1，如果不開發票，那么工廠不是要虧本么？他的原材料是交了增值稅的，結果沒有向外貿公司代繳/
   答:工廠購買原材料的下線加工戶沒給開工廠發票,也就是說沒發票的進料和不開票銷售都是第二套帳.

2,  稅務部門算進項和銷項的時候憑據是不是看公司的帳戶？
   銷項和進項的唯一憑據增值稅專用發票.

3， 公司的增值稅發票是向哪兒購買過來的么？ （不然可以亂開呀）
    有需求就會有市場.君不見賣核銷單都做網上來了么,賣發票當然多的是...

4， 如果象第一種情況 工廠不開票給外貿公司（報不含稅價格），那么是不是外貿公司要把錢打到工廠老板的個人帳戶才能行得通？
    完全正確. 錢如果打到公司帳戶,會計沒辦法只能使用違法操作辦法,但查到會被視作無發票銷售,全額征稅,一般會計會警告老板,嚴禁無發票的貨款打到公司帳戶.